생물반응기는 형태에 따라 공기 부양식 생물반응기, 교반식 생물반응기, 혼합형 생물반응기 그리고 세포고정용 생물반응기 등으로 나눌 수 있다.

공기 부양식 생물반응기는 외부에서 주입하는 공기에 의해 배양기내의 유체흐름이 일어나 그 결과 배양체가 일정한 형식으로 움직이면서 생장 및 증식이 일어나도록 하는 것이며, 교반식 생물반응기는 배양기내 유체 흐름이 외부에서 제공되는 동력과 내부에 연결된 교반날개에 의해 이뤄지는 방식으로 미생물 배양, 발효 및 식물배양체의 대량배양에도 널리 이용되는 형태다.

또한 혼합형 생물반응기는 생물반응기내 유체 흐름을 공기와 교반날개를 동시에 이용하는 것으로 공기부양식 생물반응기와 교반식 생물반응기를 합쳐 놓은 것으로 식물배양체의 고농도 배양에 사용되기도 하며 세포고정용 생물반응기는 배양기내에 세포가 부착돼 생장할 수 있는 지지체(support 혹은 matrix)를 넣어서 연속 배양하는 것으로 식물에 있어서는 유용한 이차대사산물의 생산성 향상이나 생체변환 및 단세포성 세포를 얻기 위한 연구에 주로 사용되는 생물반응기다.

<자료=국립산림과학원>
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