[환경일보] 이채빈 기자 = 농촌진흥청은 유전체 정보를 활용해 개별 종돈장(씨돼지 농장)에서도 우수한 씨돼지를 쉽게 선발할 수 있는 ‘원클릭 유전체 선발 및 최적 교배 1호’ 프로그램을 개발했다고 1일 밝혔다.

유전체 선발(Genomic selection)은 개체의 유전체 정보와 표현형, 가계(家系) 정보를 결합해 씨가축을 선발하는 방식이다. 기존보다 우수한 씨돼지를 정확하게 뽑을 수 있다.

이번에 개발한 프로그램은 검증된 평가 기법과 교배 방식 적용으로 유전체 평가 기능을 통합해 쉽게 활용할 수 있도록 했다. 자료 검증 → 유전체육종가(유전능력) 계산 → 후보선발 → 교배 조합표 제작 등 각각의 과정을 실행파일 하나로 일원화했다.

일반적으로 돼지 한 마리에서 6∼7만여개 단일염기다형성(SNP) 마커를 분석한다. 이러한 빅데이터를 통계 기술과 프로그래밍을 통해 효율적으로 관리할 수 있다.

프로그램을 설치할 때는 종돈장에서 원하는 경제형질이나 개량 목표 등을 설정해야 한다.

가계, 표현형, 유전체 정보를 사전 자료 폴더에 따로 정리한 뒤 실행 파일(Estimation)을 클릭하면 ‘후보 씨돼지별 유전체 육종가’, ‘선발 및 교배조합’ 등 결과를 확인할 수 있다.

현재 ‘원클릭 유전체 선발 및 최적 교배 1호’는 프로그램 등록을 진행하고 있다. 11월께 희망 종돈장에 기술을 이전해 씨돼지 선발에 활용하도록 할 계획이다.

농진청은 개별 종돈장의 특성을 반영한 맞춤형 버전으로 프로그램을 보급할 예정이다. 또 국내 대표 종돈업체에 기술이전을 위한 상담도 진행하고 있다.